生物染色的盘算是增强标本结构在显微镜下的反差和区别率。跟着近代对生物显微结构的不雅察究诘，染色时刻从原始的染料着色操作演变成一门系统的学问。生物染色波及的科学旨趣得以寂静揭示大奶喵喵酱，并出现了挑升术语。迄今国法，染色时刻仍在寂静发展，而专科术语需要保持一定的络续性和褂讪性。因此，不少染色法关连术语带有强横的历史颜色。从科学旨趣上默契生物染色术语，有助于掌执和练习诈欺万般染色时刻。

1. 生色团和助色团

 使有机物分子产生形势的基团称为“生色团”（chromophore）。生色团含有不敷裕键，当有机物分子中具有生色互助构时，其继承光谱将由紫外向可见光（波长变长）场地移动，从而知道出特征性形势。基愉快趣是这些基团能发生π → π*或n → π*跃迁。加入生色团的有机分子并非一定有形势，还需要变成较大的共轭体系，使π电子的行为性增大，更容易发生跃迁。如图1，联苯是无色分子；加入乙烯基这个生色团后，二苯乙烯仍然无色；但加入多个乙烯基变成的二苯基共轭辛四烯，由于共轭体系较大，就知道出绿色。

 生色团的种类许多，比如乙烯基、硝基、亚硝基、偶氮基、对醌基、邻醌基等。生色团的化学性质、继承波长和吸光能力的参数可在化学手册上查到。若是具有生色团的有色分子同期又与某种生物分子具有亲和力，则具备了充任“生物染色剂”的基本条款。不然，仅有形势而弗成着染生物分子的化合物，称为“色原”（chromogen）。

 此外，能使色原或潜在色原分子形势加深，或极性加大，或与生物分子着染的亲和力增强的基团，称为“助色团”（auxochrome）。助色团经常是含有杂原子的敷裕基团，如羟基、巯基、氨基、卤素等。杂原子的未共用p电子对变成p-π共轭，使助色团产生n → π*跃迁，于是继承光谱向长波场地移动，且吸光能力可能增强（形势更深）。图2展示了形势加深、极性加大和着染亲和力增强的3个例子。

（A）形势加深效应；（B）极性加大；（C）亲和力增强（三硝基苯在加入助色团成为三硝基苯酚后，与卵白质的亲和力增强，成为确实的染色剂）。图中虚线框示助色团。

2. 生物染色剂的酸碱性十分用途分类

 具有形势且能与生物分子亲和的生物染色剂有许多种。其中有的索取自自然的动植物因素，如苏木素、胭脂红、地衣红等；还有更多的则是笔据生色团和助色团旨趣东说念主工合成的化合物，如伊红、苏丹III、甲苯胺蓝等。

 按照染色剂的化学性质，可大概分为酸性和碱性两种。这里的酸碱性并不是指染色剂的溶液呈酸性或碱性，而是针对助色团而言的（图3）。酸性染色剂含有酸性助色团，水溶液中电离出的有色且有染色亲和力的离子为阴离子，故又称阴离子染色剂。伊红、桔黄G、三硝基苯酚、刚果红等属于此类。酸性染色剂经常着染细胞质等“嗜酸性”的因素。

 违犯，碱性染色剂含有碱性助色团，水溶液中电离出的有用染色因素为阳离子，故又称阳离子染色剂。中性红、亚甲基蓝、甲苯胺蓝、甲基绿等属于此类。碱性染色剂经常看成胞核染色剂，并可知道其他某些“嗜碱性”的因素。

 苏木素（hematoxylin）等少数染色剂的性质比拟终点。苏木素分子需要合适氧化（称“苏木红”（hematein），如图4）才具有染色亲和力。此时，分子内含有酸性助色团酚羟基，但该基团酸性很弱，对染色亲和力无本色性孝顺。半氧化的苏木素必须与铝或铁等化合物都集，成为带正电荷的染色离子。故苏木素诚然莫得碱性助色团，但践诺上组成的染色离子为阳离子，当属碱性染料。

 按照着染结构的不同，可将生物染色剂分为胞核染色剂、胞浆染色剂和终点因素染色剂（如着染糖类、脂类、核酸等）。常用染色剂的称呼和用途见表1。